Il s'agit d'un noyau urbain dépendant de l’Escala , conservé comme village médiéval. Il était autrefois une péninsule qui accueillit les premiers habitants à partir du IXe siècle av. J.-C. Trois siècle plus tard, des relations commerciales naquirent avec les phéniciens, les carthaginois et les massaliotes, marquant le début des négociations qui feront d’Empúries l'un des ports les plus importants de la Méditerranée. Dès lors, Sant Martí d’Empúries a toujours été habité.
Jusqu'en 1064, Sant Martí était la capitale du comté d'Empúries . Une bonne partie de la muraille médiévale a été conservée. L’église de Sant Martí a été construite en 1538, sur le temple pré-roman datant de 926. Contrastant avec le caractère médiéval de la ville, on trouve également à Sant Martí la Casa Forestal , de style moderniste, actuellement siège de la fondation Iberia Graeca . Juste en face se trouvent les ruines du vieux château qui inspira Victor Mora , créateur de la bande dessinée Capitán Trueno , pour imaginer le lieu de vie du héros.
S'aventurer dans les rues étroites de Sant Martí est une expérience qui vaut la peine. La plaça Major abrite plusieurs restaurants qui proposent d'intéressants menus gastronomiques. Une fois ce lieu visité, il est également conseillé de parcourir le passeig d’Empúries , qui relie Sant Martí au noyau urbain de l’Escala. Cette promenade d'environ deux kilomètres permet de découvrir les plages d’Empúries , de passer juste à côté du gisement gréco-romain d’Empúries et d'admirer l'ancien Moll Grec .